Doç.Dr.Mehmet Ali ERGÜN  

e-mail:

ergun@tr.net

aliergun@gazi.edu.tr

Adres:

Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Genetik Anabilim Dalı Beşevler Ankara

Telefon:

202 4637 (Oda)

202 6944-6943 (Laboratuvar)

202 4675 (Tıp Bilişimi AD)

KISA ÖZGEÇMİŞ

Malatya, 1970 doğumluyum. TED Ankara Koleji’nden 1988 yılında mezun oldum ve aynı yıl Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi’nde eğitim görmeye başladım. Kasım 1999’da Tıbbi Genetik Uzmanı oldum. 2000 yılında Ankara Zübeyde Hanım Doğumevi’nde çalıştıktan sonra, askerlik hizmetimi aynı yıl içinde yerine getirdim. Ekim 2000 yılında Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı’nda Uzman kadrosuna atandım. 2003 yılında Tıbbi Genetik Anabilim Dalı’nda göreve başladım. Ekim 2006 tarihinde Tıbbi Genetik alanında Doçentlik ünvanı aldım. Tıp Bilişimi Anabilim Dalı’nda görevlendirmeyle öğretim üyesi olarak çalışmaktayım. Aynı zamanda, Bilişim Enstitüsü'nde Müdür Yardımcısı olarak görev yapmaktayım.

 Uluslararası hakemli dergilerde yayımlanan makaleler

1. Zareie, H.M., F.İ. Şahin, M.A. Ergün, C. Koçum, S. Menevşe, A. Menevşe ve E. Pişkin, “Interactions of DNA with Fluorescent Dyes: by Scanning Tunneling Microscopy”. Int. J. Biol. Macromol., 23, 7-10 (1998).

2. Ergün, M.A., E. Tan, F.İ. Şahin ve A. Menevşe, “Numerical Chromosome Abnormalities Detected by Atomic Force Microscopy”, Scanning, 21, 182-186 (1999).

3. Şahin, F.İ., M.A. Ergün,  E. Tan ve A. Menevşe, “The Mechanism of G-banding Detected by Atomic Force Microscopy”, Scanning, 22, 24-27 (2000).

4. Şahin, F.İ., İ. Şahin, M.A. Ergün ve Ö.F. Saraçoğlu, “Effects of Estrogen and Alendronate on Sister Chromatid Exchange (SCE) Frequencies in Postmenopausal Osteoporosis Patients”, Int. J. Gynecol. Obstet., 71, 49-52 (2000).

5. Tan, E., F.İ. Şahin, M.A. Ergün, İ. Ercan ve A. Menevşe, “C-banding Visualized by AFM Scanning”, 23, 32-35 (2001).

6. Ergün, M.A., M.Y. Karaoğuz, E. Tan, G.D. İnce ve A. Menevşe, “Determination of A Translocation Chromosome by Atomic Force Microscopy”, Scanning, 24, 204-206 (2002).

7. Konaç, E., M.A. Ergün, F.İ. Şahin ve A. Ekmekci, “Detection of p53 Deletions Using FISH Values in the HL-60, Daudi, Raji and K-562 Cell Lines”, Exp. Oncol., 25, 33-35 (2003).

8. Erden, C.D., A. Ekmekci, F.İ. Şahin, M.A Ergün, G. Öztürk ve D. Erbaş, “L-Arginine and Mitomycin C Induced Apoptosis in Human Lymphocyte Cultures”, Cell Biol. Int., 27, 337-340 (2003).

9. Denkbaş, E.B., E. Öztürk, N. Özdemir, K. Keçeci ve M.A Ergün, EGF Loaded Chitosan Sponges as Wound Dressing Material”, J. Bioact. Compat. Pol., 18, 177-190 (2003).

10. Yurtcu, E., M.A. Ergün ve A. Menevşe, The Apoptotic Effect of Gossypol on the Human Lymphocytes”, Cell Biol. Int., 27, 791-794 (2003).

11. Mercanoğlu, B., S.A. Aytaç, M.A. Ergün ve E. Tan, Isolation of Listeria monocytogenes by Using Immunomagnetic Separation (IMS) Technique and Atomic Force Microscopy (AFM) in Buffer Solution”,  J. Microbiol., 41, 144-147 (2003).

12. Aytaç, S.A., B. Mercanoğlu, M.A Ergün ve E. Tan, The Visualisation of Salmonella Enteritidis by Atomic Force Microscopy”, Ann. Microbio., 53, 65-70 (2003).

13. Ergün, M.A., E. Konaç, D. Erbaş ve A. Ekmekci A, “Apoptosis and Nitric Oxide Release Induced by Thalidomide, Gossypol and Dexamethasone in Cultured Human Chronic Myelogenous Leukemic K-562 Cell Line”, Cell Biol. Int., 28, 237-242 (2004).

14. Zafer, E., M.A. Ergün, G. Alver, F.İ. Şahin, Ş. Yavuzer ve A. Ekmekci, “Detection and Typing of Human Papillomavirus in Non-Small Cell Lung Cancer”, Respiration, 71, 88-90 (2004).

15. Yalçın, R., A. Erkan, M.A. Ergün ve E. Yurtcu, “The Effect of Clopidogrel on Apoptosis- An In Vivo Study”, Cell Biol. Int., 28, 477-481 (2004).

16. Ergün, M.A., S. Balcı, E. Konaç, D. Kan, S. Menevşe ve O. Bartsch, “Trisomy of 8q22.3~q23-qter Following An Unbalanced 1;8 Translocation in A Boy with Multiple Anomalies”, Turkish J. Pediatr., 46, 384-387 (2004).

17. Biri, A., M. Yirmibeş Karaoğuz, G.D. İnce, M.A Ergün, S. Menevşe ve B. Bingöl, “Double Aneuploidy Involving Trisomy 7 with Potter Sequence”, Eur. J. Med. Genet., 48, 67-73 (2005).

18. Konaç, E., A. Ekmekci, E. Yurtcu ve M.A Ergün, “An In Vitro Study of Cytotoxic Effects of Gossypol on Human Epidermoid Larynx Carcinoma Cell Line (HEp-2)”, Exp. Oncol., 27, 81-83 (2005).

19. Çelik M., F. Ünal, D. Yüzbaşıoğlu, M.A. Ergün, O. Arslan ve R. Kasap, “In Vitro Effect of Karathane LC (dinocap) on Human Lymphocytes”, Mutagenesis, 20, 101-104 (2005).

20. Ergün, U., E. Yurtcu ve M.A Ergün, “Protective Effect of Ginkgo Biloba against Gossypol-Induced Apoptosis in Human Lymphocytes”, Cell Biol. Int., 29, 717-720 (2005).

21. Engin, A.B., M.A. Ergün, E. Yurtcu, D. Kan ve G. Şahin, “Effect of Ionizing Radiation on Pteridine Pathway and Evaluation of its Cytotoxicity in Exposed Hospital Staff”, Mutat. Res.Gen. Tox. En., 585, 184-192 (2005).

22. Yılmaz, M., M.A. Ergün, A. Karakoç, E. Yurtcu, İ. Yetkin, G. Ayvaz, N. Çakır ve M. Arslan, “Pro12Ala Polymorphism of the PPAR-g Gene, In First Degree Relatives Subjects with Polycystic Ovary Syndrome”, Gynecol. Endocrinol., 21, 206-210 (2005).

23. Ergün M.A., M.Y. Karaoğuz, A. Biri, E. Pala ve M. Kuşkucu, “An early prenatal diagnosis of a 69,XXY case using Quantitative Fluorescent PCR (QF-PCR) in uncultured amniocytes”, Korean J. Genet., 28, 71-74 (2006).

24. Öztürk E., Ergün M.A., Öztürk Z., Nurözler A.B., Keçeci K., Özdemir N., Denkbas E.B., Chitosan coated alginate membranes for cultivation of limbal epithelial cells to use in the restoration of damaged corneal surfaces, International Journal of Artificial Organs, 29, 228-238 (2006).

25. Keramettin O., Coban Y., Uzel M., Ergun M.A., Oksuz H., Pierre Robin Sequence with Esophageal Atresia and Congenital Radioulnar Synostosis, The Cleft Palate-Craniofacial Journal, 43, 317-320 (2006).

26. Ergün, M.A., Y. Soysal, E. Kısmet, C. Akay, R. Dündaroz, M.İ. İlhan ve N. İmirzalıoğlu, “Investigating  the In Vitro Effect of Taurine on the Infant Lymphocytes by Sister Chromatid Exchange”, Pediatr. Int., 48, 284-286 (2006).

27. Bartsch O, Ergun MA, Balci S, Kan D, Eggermann T, Kotzot D.: Two Complementary Recombinant Chromosomes 5 In A Healthy Woman, Cytogenet Genome Res, 114,178-182 (2006).

28. Karaoğuz M.Y., F. Bal, T. Yakut, N.Ö. Erçelen, Ergün M.A., A.B. Gökçen, A.A. Biri, Y. Kimya, B. Urman, M. Gültomruk, Ü. Egeli ve S. Menevşe, “Cytogenetic Results of Amniocentesis Materials: Incidence of Abnormal Karyotypes in the Turkish Collaborative Study”, Genet. Couns.,17,69-80 (2006).

29. Yilmaz M., M.A. Ergün,A. Karakoc, E. Yurtcu, N. Cakir ve M. Arslan,  M, “Pro12Ala polymorphism of the peroxisome proliferator-activated receptor-gamma gene in women with polycystic ovary syndrome”, Gynecol Endocrinol., 22, 336-42 (2006).

30. Karaer K, Karaoguz MY, Ergun MA, Yesilkaya E, Bideci A, Percin EF. Floating-Harbor syndrome: a first female Turkish patient? Genet Couns. 17:465-8 (2006).

31. Biri A, Yurtcu E, Ciftci B, Korucuoglu U, İlhan MN, Ergun MA, Gursoy R, Biberoglu K, “Apoptosis in raloxifene-treated postmenopausal women” Cell Biology International, (2007) 31:289-92.

32. Yilmaz, Akin, Menevse S, Erkan Aycan, Ergun MA, Ilhan MN, Cengel A, Yalcin R. The relationship of the ESR1 gene polymorphisms with the presence of coronary artery disease determined by coronary angiography. Genetic Testing basım için kabul edildi (2007).

33. Yurtcu E, Guney Y, Ergün MA, Guney HZ, Uluoglu C, Hicsonmez A, Yucel B, Ozbey G, Zengil H. Lack of a time-dependent effect of melatonin on radiation-induced apoptosis in cultured rat lymphocytes. Cell Biology International,  basım için kabul edildi (2007) 

34. Balcı S, Ergün MA, Konuk B, Bartsch O, Rubinstein-Taybi syndrome with normal FISH result and CREBBP gene analysis; A case report, Turkish J. Pediatr basım için kabul edildi  (2007).

35. Koc A, Kan D,Karaer K, Ergun MA, Karaoğuz MY, Gücüyener K, Hinreiner S, Liehr T, Percin EF. An Unexpected Finding in a Child with Neurological Problems: Mosaic Ring Chromosome 18. European Journal of Pediatrics  basım için kabul edildi (2007)

Ulusal hakemli dergilerde yayımlanan makaleler

1. Şahin, F.İ., M.A. Ergün, E. Tan, İ. Ercan ve A. Menevşe, “Visualizing Robertsonian Translocation with Atomic Force Microscopy”, Gazi Medical Journal, 10, 110-113 (1999). 

2. Karaoğuz, M.Y., G.D. İnce, M.A. Ergün VE T. Nas, “Chromosomal Abnormalities in Habitual Abortions: A Study of 192 Couples”, Gülhane Tıp Dergisi, 44, 40-42 (2002).

3. Ergün, M.A., E. Konaç ve D. Kan, “Retrospektif Olarak 450 Hastanın Sitogenetik  Değerlendirilmesi”, Kadın Doğum Dergisi, 1, 142-144 (2002).

4. Yılmaz, Z., M.A. Ergün ve Tan E, “Chromosomes of a Balanced Translocation Case Evaluated with Atomic Force Microscopy”, Journal of Cell and Molecular Biology, 2, 39-42, (2003).

5. Konaç, E., M. Yirmibeş Karaoğuz, M.A. Ergün ve T. Nas, “Cytogenetic Evaluation of Cordocentesis Materials in Prenatal Diagnosis and Application of the “FISH Technique” to Detect the Maternal Cell Contamination”, Gazi Medical Journal, 15, 97-100, 2004. 

6. Ergün, M.A., Y. Soysal, G.D. Akay ve N. İmirzalıoğlu, Screening the women with habitual abortions for Factor II G20210A and Factor V G1691A mutations in Turkish population”, GORM (Gynecology Obstetrics & Reproductive Medicine),11, 93-95, 2005.

7. Ergün, M.A., Soysal Y, Akay GD, İmirzalıoğlu N.: “The importance of genetic counseling in couples complaining from habitual abortions”, GORM (Gynecology Obstetrics & Reproductive Medicine), 11,90-92,2005.

8. Ergün, M.A., G.D. Akay ve N. İmirzalıoğlu, “Prenatal Diagnosis of A Fetus with Distal Trisomy 10q and the Importance of Genetic Counseling”, Kocatepe Tıp Dergisi, 6, 57-58, 2005.

9. Barkar V, Yilmaz A, Ergun MA, Ezgu FS, Menevse A, Hasanoglu A.:Türk Toplumunda Tip I Mukopolisakkaridoz’un Moleküler Analizi. Turkiye Klinikleri J Pediatr Sci 1(10):127-128,2005.

 Projelerde Yaptığı Görevler

1. Atomik Kuvvet Mikroskobunun Sitogenetik Analizde Kullanımı, Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi 01/98-01, Araştırıcı, 2001 (tamamlandı).

2. Gen Tedavisinde Kullanılmak Üzere Polimerik Nanopartiküllerin Hazırlanması ve Uygulanabilirliğinin Araştırılması, Hacettepe Üniversitesi Araştırma Fonu Projesi, 01G012, Araştırıcı, 2001 (tamamlandı).

3. İyonlaştırıcı Radyasyonun Malzemelerdeki Etkilerinin İncelenmesi; AFM ile Kromozom Görüntülenmesi, Türkiye Atom Enerjisi Kurumu Projesi, AP2.D.2, Araştırıcı, 2004 (tamamlandı).

4. Kornea Tedavisinde Kullanılmak Üzere Limbal Epitel Hücrelerin Kültüre Edileceği Polimerik Matrikslerin Hazırlanması ve Karakterizasyonu, TUBİTAK Araştırma Projesi TBAG 2254, Araştırıcı, 2005 (tamamlandı).

5. Akut Miyokard İnfarktüsünde IL-6 Gen Polimorfizminin IL-6 ve Diğer İnflammatuar Sitokin Düzeyleri ile İnfarkt Yaygınlığı, Koroner Arter Hastalığının Yaygınlığı ve Hastane İçi Sağkalım Üzerine Etkisi, Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi 01/2002-66, Araştırıcı, 2002 (tamamlandı).

6. Antidepresan Kullanan Major Depresyon Olgularında Serotonin Transporter Gen Polimorfizminin Tedaviye Yanıtla Olan İlişkisi, Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi 01/2002-67, Araştırıcı, 2002 (tamamlandı).

7. Nazal Polipozisli Hastalarda Kistik Fibrozis Mutasyonlarının Araştırılması, Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi TF 01/2003-49, Araştırıcı, 2003 (tamamlandı).

8. Koroner Arter Hastalığının Yaygınlığı ve Ciddiyeti İle Östrojen Reseptör Gen Polimorfizmi Arasındaki İlişki, Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi 01/2003-53, Araştırıcı, 2003 (tamamlandı).

10. Mesane Tedavisinde Kullanılmak Üzere Hücre-Biyopolimerik Matriks Kompozitlerinin Hazırlanması ve Karakterizasyonu, Hacettepe Üniversitesi Bilimsel
Araştırmalar Birimi Projesi 04A601001, Araştırıcı, 2004.

10. Selektif Estrojen Reseptör Modülatörü Raloksifen'in Kardiyovasküler Sistem, Lipid Profili ve İnflamasyon Belirteçleri Üzerindeki Etkisi ve Estrojen Reseptör Gen Polimorfizmi ile Raloksifen Tedavisine Yanıt Arasındaki İlişki, Gazi Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Projesi 1/2004-50, Araştırıcı, 2004 (tamamlandı).

11. Türk Popülasyonunda Gebe Olan ve Olmayanlarda Pseudokolinesteraz Gen Asp70Gly Mutasyonunun Enzim Düzeyleri ile Araştırılması, Gazi Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Projesi 1/2004-58, Araştırıcı, 2004 (devam ediyor). 

12. Faktör V Leiden ve Protrombin 20210 Gen Mutasyonlarının Atriyal Fibrilasyonlu Hastalarda İntrakardiyak Trombüs ve Stroke Sıklığı ile İlişkisi, Gazi Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Projesi BAP 1/2004-59, Araştırıcı, 2004 (tamamlandı).

13. Türk Halkında Kalpain 10 gen Polimorfiziminin (UCSNP 43 ve UCSNP 44 Sıklığının) Araştırılması: Tip 2 Diyabet, Dislipidemi, Hipertansiyon, Obezite ve Koroner Arter Hastalığı ile İlişkisi, Gazi Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Projesi 1/2004-67, Araştırıcı, 2004 (tamamlandı).

14. Türk Toplumunda Beta1-Adrenerjik Reseptör Polimorfizmi ile Kalp Krizi Arasındaki İlişkinin Araştırılması, Gazi Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Projesi 01/2004-75, Araştırıcı, 2004 (tamamlandı).

15. Obezite Tanısı Almış Çocuklarda Apolipoprotein E ve Dopamin D2 Reseptör Gen Polimorfizmlerinin PCR ve RFLP Yöntemi ile Belirlenmesi, Gazi Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Projesi 1/2004-97, Proje Yöneticisi, 2004 (devam ediyor).

16. Fibrillin-1 Gen Polimorfizmi ve Mitral Kapak Hastalığı Riski, Gazi Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Projesi 01/2005-56, Araştırıcı, 2005 (tamamlandı).